آموزش برنامه‌نویسی پایتون با رویکرد بیوانفورماتیکی

پایتون با رویکرد بیوانفورماتیکی

پایتون (Python) یکی از زبان‌های برنامه‌نویسی پرکاربرد در بیوانفورماتیک و علوم زیستی محاسباتی است. ساختار نسبتاً ساده، کتابخانه‌های متنوع و ابزارهای متعدد برای پردازش و تحلیل داده‌ها، این زبان را به یکی از گزینه‌های مناسب برای کار با داده‌های زیستی تبدیل کرده است.

برای مثال، پایتون در بیوانفورماتیک برای کار با توالی‌های DNA و پروتئین و پردازش فایل‌های زیستی استفاده می‌شود. همچنین، می‌توان از آن برای تحلیل داده‌ها، خودکارسازی فرایندهای محاسباتی و توسعه اسکریپت‌های مورد نیاز در پروژه‌های پژوهشی استفاده کرد. بنابراین، آشنایی با پایتون می‌تواند مهارت مهمی برای فعالیت در حوزه بیوانفورماتیک و علوم زیستی محاسباتی باشد.

دوره پایتون با رویکرد بیوانفورماتیکی

در این دوره، اصول برنامه‌نویسی پایتون با تمرکز بر کاربردهای آن در بیوانفورماتیک و علوم زیستی آموزش داده می‌شود. شرکت‌کنندگان ابتدا با مفاهیم پایه برنامه‌نویسی آشنا می‌شوند و سپس نحوه استفاده از پایتون برای کار با داده‌ها و مسائل زیستی را به‌صورت عملی تمرین می‌کنند.

در نهایت، انتظار می‌رود شرکت‌کنندگان بتوانند کدهای پایتون را بنویسند و اجرا کنند و همچنین از این زبان برای پردازش و تحلیل داده‌های زیستی و انجام وظایف محاسباتی در پروژه‌های بیوانفورماتیکی استفاده کنند.

سرفصل های دوره برنامه‌نویسی پایتون با رویکرد بیوانفورماتیکی:

بخش 1:

• آشنایی با دوره و نصب پایتون
• سایت‌های آنلاین و ابزارهای اجرای کدهای پایتون
• مفهوم متغیر و قوانین تغییر متغییر
• کامنت‌گذاری و تنظیمات نمایش IDLE
• عملگرهای ریاضی
• دستورات شرطی
• عملگرهای مقایسه‌ای و منطقی

بخش 2:

• اعداد مختلط
• نمادهای معنی‌دار در Print
• Short-hand if-else
• آشنایی و نصب دو IDE مهم پایتون (VS Code And Pycharm)

بخش 3:

• آشنایی با مفهوم حلقه‌های تکرار و کاربرد آن‌ها
• مفهوم تکرار و شمارش در برنامه‌نویسی
• حلقه‌ی تکرار for و کاربرد آن
• آشنایی با دستورات beak و continue

بخش 4:

• حلقه‌‌ی For تو در تو
• For else و نحوه استفاده از آن
• حلقه‌ی تکرار while

بخش 5:

• آشنایی با مفهوم تابع
• متغییر محلی و سراسری
• توابع بدون ورودی و خروجی
• مقداردهی مستقیم به ورودی‌های تابع
• کلمات کلیدی در ورودی توابع
• استفاده از یک تابع در دل یک تابع دیگر
• آشنایی با مفهوم پکیج
• بررسی پکیج Math

بخش 6:

• توابع بازگشتی
• آرایه‌ها
• پیمایش یک آرایه
• حل مثال در مورد بحث آرایه‌ها
• بررسی مثال بیان ژن‌ها
• بررسی پکیج Random و حل مثال احتمال تاس‌ها

بخش 7:

• کالکشن‌ها در پایتون
• List
• Tuple
• Set
• Dictionary

بخش 8:

• آشنایی با رشته‌ها
• پیمایش رشته‌ها
• پالیندروم
• توابع مهم برای مدیریت رشته‌ها
• حل مثال در مورد رشته‌های زیستی
• تعداد آمینواسیدها در یک رشته زیستی
• درصد GC Content در یک توالی
• hamming distance
• دیکشنری آمینواسیدها
• فرآیند ترجمه پروتئین با دیکشنری آمینواسیدها
• آشنایی با ماتریس‌ها
• پیمایش ماتریس‌ها
• کد بازی Tic Tac Toe

بخش 9:

• مدیریت استثناها و آشنایی با بلوک‌های try، except و finally
• آشنایی با انواع حالات استثنا
• کار با فایل‌ها
• خواندن اطلاعات از فایل
• مثال دفترچه تلفن‌
• کار با فایل‌های زیست و بررسی فایل‌های fasta
• تمرین با فایل fasta اسپایک پروتئین کرونا ویروس

بخش 10:

• کار با پکیج‌ها
• آموزش نصب پکیج
• بررسی مخزن Pypi
• بررسی پکیج matplotlob
• آموزش رسم پلات
• بار پلات
• نمودار پراکندگی و نمودار دایره‌ای
• کار با فایل‌های اکسل
• خواندن اطلاعات فایل اکسل
• نوشتن اطلاعات در فایل اکسل
• شیت‌بندی فایل اکسل

بخش 11:

• مقدماتی بر پکیج بایوپایتون
• نصب پکیج بایوپایتون
• مفهوم Seq در پکیج بایوپایتون
• اعمال حلقه بر روی توالی‌های زیستی
• مسیر central dogma of molecular biology
• رشته‌ی DNA
• Coding Strand
• Template Strand
• Reverse
• Reverse_complement
• Transcription
• Translation
• Codon Table
• Vertebrate mitochondrial code
• Standard Codon Table
• خواندن اطلاعات از فایل Fasta به کمک بایوپایتون
• نوشتن اطلاعات در فایل Fasta به کمک بایوپایتون
• SeqRecord
• بررسی documentation پکیج بایوپایتون
• دانلود داده از Expasy به کمک پکیج بایوپایتون
• همترازی سراسری و محلی توالی‌ها با بایوپایتون

نحوه دسترسی به دوره

این دوره به‌صورت پکیج آموزش ویدئویی و با ۶ ماه پشتیبانی آموزشی ارائه می‌شود. پس از ثبت‌نام، دسترسی به محتوای دوره از طریق حساب کاربری شما فعال خواهد شد.

لایسنس دوره امکان استفاده روی دو دستگاه، شامل یک کامپیوتر یا لپ‌تاپ و یک تلفن همراه را فراهم می‌کند. اطلاعات مربوط به لایسنس پس از ثبت‌نام از طریق پنل کاربری و بخش سفارش‌ها قابل مشاهده خواهد بود.

راهنمای اخذ گواهی پایان دوره:

در کمپ بیوانفورماتیک، یادگیری و کسب مهارت در اولویت قرار دارد و گواهی دوره صرفاً تأییدی بر شرکت و تکمیل دوره آموزشی است. توصیه می‌کنیم تمرکز اصلی شما بر یادگیری، انجام تمرین‌ها و استفاده از مهارت‌های کسب‌شده در فعالیت‌های علمی و پژوهشی باشد.

پس از پایان دوره، در صورت تمایل می‌توانید درخواست صدور گواهی شرکت در دوره را با هزینه ۱۹۰ هزار تومان ثبت کنید. گواهی‌ها از طرف کمپ بیوانفورماتیک، به زبان انگلیسی و در قالب فایل PDF صادر شده و در سامانه گواهی‌های کمپ بیوانفورماتیک ثبت می‌شوند. هر گواهی دارای Registration Number اختصاصی است و امکان استعلام آنلاین آن وجود دارد.

برای ثبت درخواست، پس از پایان دوره از طریق پشتیبانی ادمین در تلگرام، واتساپ یا اینستاگرام با ما در ارتباط باشید.

دریافت توصیه‌نامه

پس از اتمام دوره و دریافت گواهی، می‌توانید برای ارائه به دانشگاه یا سایر مؤسسات درخواست توصیه‌نامه کنید. برای صدور توصیه‌نامه لازم است حداقل سه ماه از پایان دوره گذشته باشد، تمرینات دوره را تکمیل کرده باشید و پس از دوره نیز فعالیت و ارتباط علمی مؤثری با کمپ بیوانفورماتیک داشته باشید. توصیه‌نامه بر اساس بررسی فعالیت‌ها و عملکرد شما صادر می‌شود. برای هر دوره یک توصیه‌نامه قابل دریافت است و هزینه صدور آن ۲۹۰ هزار تومان است.