آموزش داکینگ مولکولی در طراحی دارو و واکسن

آموزش داکینگ مولکولی در طراحی دارو و واکسن

داکینگ مولکولی (Molecular Docking) یکی از روش‌های محاسباتی پرکاربرد برای بررسی و پیش‌بینی نحوه برهم‌کنش میان مولکول‌ها است. این روش می‌تواند برای مطالعه سیستم‌هایی مانند پروتئین–لیگاند و پروتئین–پروتئین و بررسی حالت‌های احتمالی اتصال و برهم‌کنش‌های مولکولی مورد استفاده قرار گیرد.

داکینگ در مطالعات طراحی محاسباتی دارو و واکسن می‌تواند به بررسی کاندیداها، تحلیل نحوه اتصال به اهداف مولکولی و اولویت‌

دوره آموزش داکینگ مولکولی

در این دوره، اصول و مراحل اصلی Molecular Docking به‌صورت گام‌به‌گام و عملی آموزش داده می‌شود. شرکت‌کنندگان با آماده‌سازی ساختارهای مولکولی، انتخاب و آماده‌سازی هدف، تنظیم پارامترهای داکینگ، اجرای فرایند داکینگ و تحلیل برهم‌کنش‌های حاصل آشنا می‌شوند.

در پایان دوره، انتظار می‌رود شرکت‌کنندگان بتوانند یک مطالعه داکینگ مولکولی را متناسب با مسئله پژوهشی خود طراحی و اجرا کرده و نتایج حاصل را تحلیل و تفسیر کنند.

سرفصل‌های دوره:

• مقدمه‌ای بر آموزش داکینگ مولکولی
• تعریف داکینگ
• ورودی‌های داکینگ
• کاربرد داکینگ در طراحی واکسن
• کاربرد داکینگ در طراحی دارو
• فعالیت ترکیبات دارویی
• انواع داکینگ
• مفهوم Active Site
• پیشگویی Active Site
• خروجی داکینگ
• دانلود ساختار ترکیبات شیمیایی
• آشنایی با پایگاه‌داده‌های دانلود ساختار ترکیبات شیمیایی
• آشنایی با یکسری از نرم‌افزارهای کمکی  و نصب نرم‌افزارها
• جاوا
• هایپرکم
• Notepad++
• Open Babel
• تبدیل فرمت ترکیبات شیمیایی به هم
• ترسیم ساختار ترکیبات شیمیایی
• بهینه کردن ساختار ترکیبات شیمیایی
• پایگاه‌داده‌های مربوط با پروتئین‌ها
• آشنایی با پایگاه داده PDB
• آشنایی با نرم‌افزار Yasara
• پیشگویی ساختار پروتئین‌ها و سرورهای این حوزه
• پیش‌پردازش داده‌ها  در چند مرحله
• آشنایی با نرم‌افزار chimera
• سرور Hdock
• ارزیابی و امتیازدهی نتایج داکینگ
• RMSD
• ارزیابی جزئی‌تر نتایج داکینگ
• Lzerdwebina
• PyDock
• CB-Dock
• Z-Dock
• Covid-19 Docking Server

نحوه دسترسی به دوره

این دوره به‌صورت پکیج آموزش ویدئویی و با ۶ ماه پشتیبانی آموزشی ارائه می‌شود. پس از ثبت‌نام، دسترسی به محتوای دوره از طریق حساب کاربری شما فعال خواهد شد.

لایسنس دوره امکان استفاده روی دو دستگاه، شامل یک کامپیوتر یا لپ‌تاپ و یک تلفن همراه را فراهم می‌کند. اطلاعات مربوط به لایسنس پس از ثبت‌نام از طریق پنل کاربری و بخش سفارش‌ها قابل مشاهده خواهد بود.

راهنمای اخذ گواهی پایان دوره:

در کمپ بیوانفورماتیک، یادگیری و کسب مهارت در اولویت قرار دارد و گواهی دوره صرفاً تأییدی بر شرکت و تکمیل دوره آموزشی است. توصیه می‌کنیم تمرکز اصلی شما بر یادگیری، انجام تمرین‌ها و استفاده از مهارت‌های کسب‌شده در فعالیت‌های علمی و پژوهشی باشد.

پس از پایان دوره، در صورت تمایل می‌توانید درخواست صدور گواهی شرکت در دوره را با هزینه ۱۹۰ هزار تومان ثبت کنید. گواهی‌ها از طرف کمپ بیوانفورماتیک، به زبان انگلیسی و در قالب فایل PDF صادر شده و در سامانه گواهی‌های کمپ بیوانفورماتیک ثبت می‌شوند. هر گواهی دارای Registration Number اختصاصی است و امکان استعلام آنلاین آن وجود دارد.

برای ثبت درخواست، پس از پایان دوره از طریق پشتیبانی ادمین در تلگرام، واتساپ یا اینستاگرام با ما در ارتباط باشید.

دریافت توصیه‌نامه

پس از اتمام دوره و دریافت گواهی، می‌توانید برای ارائه به دانشگاه یا سایر مؤسسات درخواست توصیه‌نامه کنید. برای صدور توصیه‌نامه لازم است حداقل سه ماه از پایان دوره گذشته باشد، تمرینات دوره را تکمیل کرده باشید و پس از دوره نیز فعالیت و ارتباط علمی مؤثری با کمپ بیوانفورماتیک داشته باشید. توصیه‌نامه بر اساس بررسی فعالیت‌ها و عملکرد شما صادر می‌شود. برای هر دوره یک توصیه‌نامه قابل دریافت است و هزینه صدور آن ۲۹۰ هزار تومان است.