آموزش منطق و مبانی علم بیوانفورماتیک

منطق و مبانی بیوانفورماتیک

بیوانفورماتیک حوزه‌ای میان‌رشته‌ای است که از علوم زیستی، علوم کامپیوتر، آمار و روش‌های محاسباتی برای حل سوالات زیستی استفاده می‌کند. با افزایش حجم و تنوع داده‌های حاصل از مطالعات ژنومیک، ترنسکریپتومیک، پروتئومیک و سایر حوزه‌های علوم زیستی، روش‌های بیوانفورماتیکی به بخش مهمی از پژوهش‌های زیستی تبدیل شده‌اند.

آشنایی با مفاهیم پایه بیوانفورماتیک به پژوهشگران کمک می‌کند تا انواع داده‌های زیستی، پایگاه‌های داده، ابزارهای محاسباتی و منطق انتخاب روش مناسب برای یک مسئله پژوهشی را بهتر درک کنند.

دوره منطق و مبانی بیوانفورماتیک

در این دوره، مفاهیم پایه و منطق روش‌های بیوانفورماتیکی به‌صورت گام‌به‌گام آموزش داده می‌شود. شرکت‌کنندگان با انواع داده‌های زیستی، پایگاه‌های داده، توالی‌های DNA و پروتئین، جست‌وجو و مقایسه توالی‌ها و کاربرد ابزارهای اصلی بیوانفورماتیک آشنا می‌شوند.

در پایان دوره، انتظار می‌رود شرکت‌کنندگان بتوانند مسائل پایه بیوانفورماتیکی را درک کرده، منابع و ابزارهای مناسب را انتخاب کنند و از آن‌ها در مطالعات و پروژه‌های پژوهشی خود استفاده کنند.

سرفصل‌های دوره آموزش منطق و مبانی بیوانفورماتیک:

بخش اول:

• مقدمه‌ای بر آموزش مبانی بیوانفورماتیک و منطق پشت آن
• آشنایی با رشته بیوانفورماتیک
• مرور کلی Central Dogma Of Molecular Biology
• Zygote
• Cell و ساختار آن
• هسته سلول
• ژنوم، کروموزوم و DNA
• Nucleotide Bases
• Gene
• مرور کلی تولید محصولات زیستی
• آمینو اسیدها و بحث کدون
• انیمیشین سنتز پروتئین
• توالی‌یابی
• آشنایی با توالی‌یابی سنگر
• Single Nucleotide Polymorphism
• آشنایی با پایگاه داده‌های سطح ژنوم و دانلود فایل ژنوم یک باکتری از طریق پایگاه‌داده‌ها
• درصد GC Content
• اعمال کارهای محاسباتی بر روی فایل ژنوم با استفاده از وب‌سایت‌های آماده
• آشنایی کلی با زبان R و زبان پایتون و اهمیت آنها در رشته بیوانفورماتیک
• نصب پایتون و پایچارم
• نصب R و  RStudio

بخش دوم:

• آشنایی با کدنویسی در محیط پایتون و پایچارم
• آشنایی با کدنویسی در محیط R و rstudio
• اعمال کارهای محاسباتی بر روی فایل ژنوم با استفاده از وب‌سایت‌های آماده
• جمع‌بندی بخش برنامه‌نویسی در آموزش بیوانفورماتیک
• Longest common substring
• Longest common subseauence
• Global alignment

بخش سوم:

• بررسی Local alignment با مثال عملی و وب‌سایت‌های این حوزه
• بررسی Multiple alignment با مثال عملی و وب‌سایت‌های این حوزه
• نصب JDK
• بررسی longest common sunseauence با مثال عملی و وب‌سایت‌های این حوزه
• phylogenetic tree
• BLAST
• Synthetic nucleic acid
• Hachimoji DNA and RNA
• RNA and List of RNAs
• Primary Structure of RNA
• اعمال کارهای محاسباتی بر روی فایل توالی RNA
• Secondary Structure of RNA
• روش‌های نمایش ساختار دوم RNA
  • فین‌من خطی
  • فین‌من دایره‌ای
  • نمایش ساختاری
  • نمایش دات‌براکت
• آشنایی با نرم‌افزاری برای نمایش ساختار دوم RNA
• آشنایی با زیرساختارهای ساختار دوم RNA
• Tertiary Structure of Rna and pseudoknot
• آشنایی با پایگاه‌داده‌های مفید برای دانلود سطوح مختلف RNAها

بخش چهارم:

• optimization algorithms در آموزش بیوانفورماتیک
• پیش‌بینی ساختار RNAها و معرفی سرورهای این حوزه
• طراحی RNA و سرورهای این حوزه
• Primary Structure of Protein
• اعمال کارهای محاسباتی بر روی فایل توالی RNA
• Secondary Structure of Protein
• Tertiary Structure of Protein
• Quaternary Structure of Protein
• پیش‌بینی ساختار پروتئین
• پایگاه داده‌های پروتئین

بخش پنجم:

• virtual machine
• آشنایی با لینوکس و توزیع های آن
• نصب لینوکس بر روی ماشین مجازی
• آشنایی با دستورات اولیه محیط Shell لینوکس
• آشنایی با دستورات کاربردی بیوانفورماتیک در محیط Shell لینوکس
• کار با فایلهای متنی در لینوکس

نحوه دسترسی به دوره

این دوره به‌صورت پکیج آموزش ویدئویی و با ۶ ماه پشتیبانی آموزشی ارائه می‌شود. پس از ثبت‌نام، دسترسی به محتوای دوره از طریق حساب کاربری شما فعال خواهد شد.

لایسنس دوره امکان استفاده روی دو دستگاه، شامل یک کامپیوتر یا لپ‌تاپ و یک تلفن همراه را فراهم می‌کند. اطلاعات مربوط به لایسنس پس از ثبت‌نام از طریق پنل کاربری و بخش سفارش‌ها قابل مشاهده خواهد بود.

راهنمای اخذ گواهی پایان دوره:

در کمپ بیوانفورماتیک، یادگیری و کسب مهارت در اولویت قرار دارد و گواهی دوره صرفاً تأییدی بر شرکت و تکمیل دوره آموزشی است. توصیه می‌کنیم تمرکز اصلی شما بر یادگیری، انجام تمرین‌ها و استفاده از مهارت‌های کسب‌شده در فعالیت‌های علمی و پژوهشی باشد.

پس از پایان دوره، در صورت تمایل می‌توانید درخواست صدور گواهی شرکت در دوره را با هزینه ۱۹۰ هزار تومان ثبت کنید. گواهی‌ها از طرف کمپ بیوانفورماتیک، به زبان انگلیسی و در قالب فایل PDF صادر شده و در سامانه گواهی‌های کمپ بیوانفورماتیک ثبت می‌شوند. هر گواهی دارای Registration Number اختصاصی است و امکان استعلام آنلاین آن وجود دارد.

برای ثبت درخواست، پس از پایان دوره از طریق پشتیبانی ادمین در تلگرام، واتساپ یا اینستاگرام با ما در ارتباط باشید.

دریافت توصیه‌نامه

پس از اتمام دوره و دریافت گواهی، می‌توانید برای ارائه به دانشگاه یا سایر مؤسسات درخواست توصیه‌نامه کنید. برای صدور توصیه‌نامه لازم است حداقل سه ماه از پایان دوره گذشته باشد، تمرینات دوره را تکمیل کرده باشید و پس از دوره نیز فعالیت و ارتباط علمی مؤثری با کمپ بیوانفورماتیک داشته باشید. توصیه‌نامه بر اساس بررسی فعالیت‌ها و عملکرد شما صادر می‌شود. برای هر دوره یک توصیه‌نامه قابل دریافت است و هزینه صدور آن ۲۹۰ هزار تومان است.