شرکت‌های بیوانفورماتیکی برتر که باید آنها را بشناسید

بیوانفورماتیک چیست

بیوانفورماتیک شاخه‌ای از علم است که با بهره‌گیری از علوم محاسباتی به حل مسائل پیچیده زیستی می‌پردازد و هدف آن دستیابی به یافته‌های ارزشمند در حوزه مراقبت‌های بهداشتی است. در این مقاله، پنج شرکت پیشرو در زمینه بیوانفورماتیک را معرفی می‌کنیم که تأثیر قابل‌توجهی در شکل‌دهی آینده این علم دارند. پیشنهاد میکنیم در کنار مطالعه این نوشته، مقاله‌ی “100 سایت بیوانفورماتیکی برتر در تمام دوران” را نیز مطالعه کنید.

شرکت Synthace

شرکت انگلیسی-آمریکایی Synthace یک پلتفرم محاسباتی پیشرفته ارائه می‌دهد که به دانشمندان علوم زیستی کمک می‌کند تا آزمایش‌های خودکار را برنامه‌ریزی، اجرا و تحلیل کنند.  Synthace در خودکارسازی فرآیندهای تحقیقاتی، به ویژه مونتاژ DNA برای پروژه‌های تحقیق و توسعه (R&D)، نقشی کلیدی ایفا می‌کند. این شرکت پیش‌تر با غول‌هایی همچون مایکروسافت یا شرکت جهانی Ipsen برای توسعه داروهای درمان بیماری‌های نادر و تسکین درد مشارکت داشته است.

سال گذشته، این شرکت در میان 50 شرکت برتر جهان، از جمله گوگل، Headspace (شرکت مراقبت‌های روانی)، و Beyond Meat (شرکت تولید مواد غذایی گیاهی)، قرار گرفت و موفق به دریافت جایزه Impact Fifty شد که به شرکت‌های تأثیرگذار بر جامعه اهدا می‌شود.

شرکت Verge Genomics

شرکت Verge Genomics در حوزه کشف و توسعه دارو، با استفاده از هوش مصنوعی (AI) پیشگام است. این شرکت از پلتفرم CONVERGE، یک سیستم یادگیری ماشینی حلقه بسته، استفاده می‌کند که داده‌های ژنومی را با ابزارهای محاسباتی ترکیب می‌کند تا اهداف دارویی جدید شناسایی کرده و اثربخشی داروهای تحقیقاتی را در مراحل کلینیکی پیش‌بینی کند. این رویکرد نوآورانه به تسریع فرآیند توسعه دارو کمک می‌کند.

در حال حاضر، Verge یک داروی تحقیقاتی برای درمان اسکلروز جانبی آمیوتروفیک (ALS) در خط تولید خود دارد. ALS یک بیماری مرگبار نورون حرکتی است که سلول‌های عصبی مغز و نخاع را تحت تأثیر قرار می‌دهد.

این شرکت علاوه بر ALS، در حال کار بر روی تولید داروهایی برای درمان بیماری‌هایی مانند پارکینسون، اسکیزوفرنی، پسوریازیس، درماتیت آتوپیک، بیماری کرون و کولیت اولسراتیو است. Verge همچنین یک برنامه همکاری مشترک با غول داروسازی Eli Lilly برای درمان ALS دارد.

اواخر سال گذشته، Verge با شرکت Alexion Pharmaceuticals، که یکی از زیرمجموعه‌های AstraZeneca است و در درمان بیماری‌های نادر تخصص دارد، وارد همکاری شد. این قرارداد به Verge امکان می‌دهد تا حداکثر 42 میلیون دلار به صورت پیش‌پرداخت و کوتاه‌مدت و تا 840 میلیون دلار در قالب پرداخت‌های مبتنی بر دستاوردهای آتی دریافت کند.

شرکت VeriSIM Life

شرکت VeriSIM Life، مستقر در کالیفرنیا، با تمرکز بر کشف و توسعه دارو، یک پلتفرم هوش مصنوعی ترکیبی ارائه داده است که هدف آن تسریع فرآیند انتقال درمان‌ها از آزمایشگاه به بیمارستان‌ها برای کمک به درمان بیماران است.

با توجه به اینکه گفته می‌شود 90 درصد از داروهای آزمایشی در مراحل کلینیکی شکست می‌خورند، پلتفرم BIOiSIM این شرکت برای پیش‌بینی احتمال موفقیت یا شکست دارو در بازار طراحی شده است. این پلتفرم، به عنوان یک موتور تصمیم‌گیری در توسعه دارو، یک “امتیاز اعتباری” برای پتانسیل هر دارو ارائه می‌دهد. این امتیاز اثربخشی، عوارض جانبی و سمیت احتمالی دارو را تجزیه و تحلیل می‌کند و همچنین تأثیرات مرتبط با گونه‌های مختلف را در نظر می‌گیرد.

با بهره‌گیری از هوش مصنوعی، BIOiSIM به کاهش ضایعات و هزینه‌های فرآیند توسعه کمک می‌کند و دقت و مقیاس‌پذیری را بهبود می‌بخشد.

پلتفرم AtlasGEN این شرکت نیز به شناسایی مولکول‌های جدید بر اساس خواص شیمیایی موردنظر کمک می‌کند. این ابزار از یک فضای جستجوی مولکولی پشتیبانی شده توسط بیش از یک تریلیون ترکیب استفاده می‌کند. پلتفرم AtlasGEN همچنین توانایی اتصال پروتئین‌ها را با استفاده از یادگیری ماشین پیش‌بینی می‌کند. طبق گزارش‌ها، این ابزار 72 درصد کارآمدتر از روش‌های سنتی مبتنی بر اتصال مولکولی است.

سال گذشته، VeriSIM Life با شرکت تحلیل‌گر Clarivate همکاری کرد تا به تسریع تحقیقات و توسعه دارو کمک کند. این همکاری منجر به راه‌اندازی پلتفرم کشف داروی Clarivate شد که بینش‌هایی در مورد ایمنی و کارایی مولکول‌ها ارائه می‌دهد.

شرکت Recursion

شرکت Recursion، یک شرکت داروسازی آمریکایی، از فناوری پیشرفته نقشه‌برداری و ناوبری خود برای کشف زیست‌شناسی بیماری‌ها و شناسایی داروهای جدید استفاده می‌کند. این شرکت به طور هفتگی تا 2.2 میلیون آزمایش را در آزمایشگاه‌های خود انجام می‌دهد تا پاسخ‌های سلولی به ناک‌اوت کل ژنوم را ثبت کند.

فرآیند تحقیقاتی در Recursion با تمرکز بر یک زمینه درمانی خاص و تجزیه‌وتحلیل مجموعه داده‌های ژنی و اهداف دارویی آغاز می‌شود. با استفاده از حذف ژن، تصویربرداری سلولی، و بهره‌گیری از یادگیری ماشینی، دانشمندان این شرکت داده‌هایی در مورد ژن‌ها و فرآیندهای مرتبط با یک بیماری خاص جمع‌آوری می‌کنند.

پلتفرم Recursion OS این شرکت، نقش کلیدی در توسعه مجموعه درمانی شرکت دارد. یکی از پیشرفته‌ترین کاندیداهای دارویی این شرکت، REC-994، یک داروی فاز 2 برای درمان ناهنجاری غار مغزی است. این وضعیت شامل تجمع غیرطبیعی رگ‌های خونی کوچک در سیستم عصبی مرکزی می‌شود. در آزمایش‌های فاز 1، این مولکول کوچک به خوبی تحمل شده است.

همچنین، داروی دیگر این شرکت، REC-2282، یک مهارکننده کوچک pan-HDAC برای درمان مننژیوم‌های جهش‌یافته NF2 است. این نوعی تومور مغزی است که تاکنون هیچ داروی تاییدشده توسط FDA ندارد. آزمایش‌های فاز 1 نشان دادند که این دارو علاوه بر تحمل‌پذیری خوب، برخلاف سایر مهارکننده‌های HDAC، سمیت قلبی کمتری دارد.

در ماه‌های گذشته، Recursion عرضه عمومی سهام خود را با قیمتی معادل 200 میلیون دلار اعلام کرد. علاوه بر این، اخیرا این شرکت یک ابررایانه NVIDIA DGX SuperPOD AI را برای تقویت توانایی‌های کشف داروی خود توسعه داد.

شرکت Twist Bioscience

Twist Bioscience، یک شرکت پیشرو مستقر در کالیفرنیا، در حوزه بیوانفورماتیک فعالیت می‌کند و خدمات متنوعی ارائه می‌دهد؛ از فروش قطعات ژنی و ژن‌های کلونال گرفته تا طراحی و تولید کتابخانه‌های پیچیده که بر اساس نیازهای مشتریان انجام می‌شود.

ماه گذشته، Twist Bioscience از کشف TB206-001، یک آنتی‌بادی طراحی‌شده برای بهبود درمان سرطان، خبر داد.

تا به امروز، این شرکت بیش از 400 کمپین موفق کشف آنتی‌بادی مونوکلونال داشته است. Twist Bioscience همچنین با بیش از 200 شرکت علوم زیستی، از جمله Takeda (ژاپن)، Bayer (آلمان)، و Boehringer Ingelheim (آلمان) همکاری داشته است.