رازهایی درمورد طراحی پروتئین که باید بدانید

طراحی پروتئین در علوم نوین

امروزه ابزارهای پیشرفته در زمینه طراحی پروتئین، به ما این امکان را می‌دهند تا ماکرومولکول‌های مختلفی، در جهت اهداف بیولوژیکی خود طراحی کنیم. حال به لطف وجود علم بیوانفورماتیک، میتوانیم قبل از ساخت آزمایشگاهی یک پروتئین، با کمک روش‌های محاسباتی، از تمام ویژگی‌های ساختاری و عملکردی پروتئین مدنظر مطلع شویم. این روش‌ها علاوه بر ارزان‌تر بودن و در دسترس‌تر بودن، نسبت به شیوه‌های قدیمی و سنتی، بسیار آسان، ارزان و کاربردی هستند.

مهندسی پروتئین

امروزه مهندسی پروتئین سهم بزرگی در مارکت کمپانی‎‌های مطرح در سرتاسر دنیا دارد. مهندسی پروتئین به ما کمک می‌کند تا با دانشی منطقی و شناخت یک پروتئین، بتوانیم تغییرات دلخواه‌مان را در آن ایجاد نموده و در جهت مقاصد خود از آن بهره ببریم. همچنین باید به این نکته اشاره کردن که با توجه به نیاز بشر در تحقیقات مختلف صنعتی، پزشکی، نانو و بیوتکنولوژی و حتی زیست محیطی، استفاده گسترده‌ای از علم مهندسی پروتئین و ژنتیک صورت می‌گیرد. شما می‌توانید مثال‌های بسیاری دیگری از کاربردهای مهندسی پروتئین را در مقاله‌ای با عنوان Tools and Applications of Protein Engineering: an Overview و با کلیک کردن بر روی این لینک مطالعه کنید.

پروتئین‌های نوترکیب

پروتئین های نوترکیب پروتئین‌هایی هستند که در expression hosts تولید می‌شوند. پروتئین‌های نوترکیب به عنوان معرف‌های تشخیصی پزشکی در مراقبت‌های بهداشتی انسان مانند واکسن‌ها، داروها یا آنتی‌بادی‌ها و همچنین در تجزیه و تحلیل بیوشیمیایی استفاده می‌شوند. امروزه نمونه‌های زیادی از پروتئین‌های نوترکیب، توسط بسیاری از غول‌پیکرترین کمپانی‌های داروسازی تولید می‌شود. تولید بسیاری از پروتئین‌های نوترکیب در سیستم‌های مختلف یوکاریوتی و یا پروکاریوتی، وابسته به طراحی قبلی پروژه و داشتن علم کافی برای Protein Design می‌باشد.

برای مثال می‌توان به انسولین که دارویی بسیار شناخته‌شده برای بیماران دیابتی می‌باشد، اشاره کرد. انسولین توسط دانش طراحی پروتئین و روش‌های نوترکیب تولید می‌شود و توسط کمپانی‌های مختلف در سراسر دنیا عرضه می‌گردد.

نقش دینامیک مولکولی در طراحی پروتئین

دینامیک مولکولی یک روش محاسباتی برای مدل‌سازی برهمکنش‌های بین مولکولی است. با استفاده از این روش شما می‌توانید، رفتار مولکول‌ها و برهمکنش‌های بین آن‌ها را درون یک سیستم مشاهده کنید.

همان‌طور که می‌دانید در بحث طراحی پروتئین، پیش‌بینی ساختار پروتئین‌ها توسط روش‌های آزمایشگاهی، بسیار هزینه‌بر هستند. اما در این عرصه علم بیوانفورماتیک به کمک پژوهشگران آمده است. شما می‌توانید در زمان اندکی، دینامیک مولکولی و داکینگ مولکولی را آموخته و در جهت پیش‌برد اهداف پژوهشی‌تان، از آنها بهره‌مند شوید.

در همین راستا کمپ بیوانفورماتیک دوره‌های شبیه‌سازی دینامیک و داکینگ مولکولی را، برای شما پژوهشگران عزیز تدارک دیده است. شما میتوانید برای ثبت نام در دوره‌های دینامیک مولکولی و داکینگ مولکولی بر روی لینک‌های زیر کلیک کنید: