بیوانفورماتیک و نقش آن در مطالعات پروتئین

مطالعات پروتئین

آیا تاکنون از خود پرسیده‌اید که بیوانفورماتیک چیست و چه نقشی در مطالعات پروتئین ایفا می‌کند؟ یا چرا باید از بیوانفورماتیک در تحقیقات مربوط به پروتئین‌ها استفاده کرد؟ این سوالات مباحثی هستند که امروز قصد داریم به بررسی آن‌ها بپردازیم. اگر به دنبال کشف نقش بیوانفورماتیک در مطالعات پروتئین هستید، مقاله امروز را از دست ندهید.

بررسی نقش بیوانفورماتیک در مطالعات پروتئین‌ها

برای بررسی نقش بیوانفورماتیک در مطالعات پروتئین، ابتدا باید مسیر central dogma در زیست‌شناسی مولکولی را درک کنیم. به زبان ساده، ژن به رشته‌ای از نوکلئوتیدها روی DNA اطلاق می‌شود که حاوی اطلاعات زیستی مهمی برای ساخت RNA‌ها هستند. از روی ژن‌ها RNA‌ها تولید می‌شوند و با کمک RNA‌های کلیدی مانند tRNA، rRNA و mRNA، پروتئین‌ها ساخته می‌شوند. بیوانفورماتیک در این مسیر از DNA تا پروتئین نقش مهمی دارد و ما امروز قصد داریم در مورد ایستگاه پروتئین‌ها با شما صحبت کنیم.

آنالیز سطوح مختلف پروتئین‌ها با استفاده از بیوانفورماتیک

هنگامی که محققان در زمینه پروتئین و سطوح مختلف آن تحقیق می‌کنند، به دلیل حجم بالای داده‌ها در هر سطح، بدون شک باید از بیوانفورماتیک بهره‌مند شوند. پروتئین‌ها دارای سطوح مختلفی هستند که عبارتند از:

سطح اول: توالی پروتئین که از بلوک‌های سازنده‌ای به نام آمینواسیدها تشکیل شده است.
سطح دوم: ساختار دوم پروتئین که شامل زیرساختارهای مهمی مانند آلفا هلیکس و بتا شیت می‌شود.
سطح سوم: ساختار سه‌بعدی و فولد شده پروتئین.
سطح چهارم: ترکیب و تعامل چندین زنجیره پپتیدی (یا زیرواحد) در یک پروتئین کامل.

کاربردهای بیوانفورماتیک در مطالعات پروتئین

در ادامه به برخی از کاربردهای بیوانفورماتیک در مطالعات پروتئین میپردازیم:

در سطح ساختار اول پروتئین میتوانیم توالی پروتئین‌های هم‌خانواده را بررسی کنیم و به اطلاعات جالب در این سطح دست پیدا کنیم.
در سطح ساختار دوم پروتئین با بررسی ساختارهای آلفاهلیکس، بتاشیت، Coil و … میتوانیم به اطلاعات مهم ساختاری در مورد پروتئین‌ها برسیم
در سطح ساختار سوم پروتئین الگوریتم‌های مختلفی برای پیشگویی ساختار سوم پروتئین‌ها موجود است.
در سطح چهارم نیز بیوانفورماتیک کاربردهای متعددی دارد که شامل تحلیل ساختاری، پیش‌بینی تعاملات و بررسی‌های عملکردی است.

پیشنهاد میکنیم برای اطلاعات بیشتر در این زمینه به این لینک مراجعه کنید و با دیگر کاربردها هم آشنا شوید

معرفی دوره منطق و مبانی علم بیوانفورماتیک

اگر شما هم به مطالعات پروتئین در بیوانفورماتیک علاقه دارید میتوانید در دوره‌ی منطق و مبانی علم بیوانفورماتیک شرکت کنید در این دوره بخش مهمی از مطالعات ما مربوط به پروتئین‌ها میباشد. بخشی از سرفصلهای این دوره در مورد پروتئین‌ها را در زیر ببینید: